Buenas,

ya lo comenté hace un par de meses: no tendremos más proyectos de Setup en Visual Studio 2012. Por suerte el equipo que empuja WiX ha decidido no dejarlo morir y ya van por la versión 3.6. En este post puedes ver las novedades que se incluyen, aunque la mejor es que es 100% compatible con VS2012.

Fuente: http://robmensching.com/blog/posts/2012/9/3/WiX-v3.6-released

Saludos @ Home

El Bruno